（一）闲置资产没有得到充分利用。村建制调整改革后，合并后的村总资产增加了，但是闲置资产数理也增加了，大部分闲置资产的利用效率都较低。因此，对于合并村闲置资产的盘活是当前较为重要且急需解决的问题。
（二）集体经济始终是块短板。对于大部分村（社区）来说，集体经济发展模式较为单一，集体经济收入较为单薄，常年入不敷出，如果村（社区）没有集体经济支撑，群众的很多矛盾问题将很难解决，这也将会影响村（社区）党组织在当地的核心作用发挥。
（三）管理服务工作还未完全跟上。行政区域及村级建制调整后，相关的管理服务后续工作还没及时跟上，比如，有的群众的户口簿、身份证、土地证、门牌信息等还未及时变更，有的社区群众还不知道自己被划归到其他社区，这些问题都给群众生产生活造成一些不便。
（四）基层治理难度和压力加大。行政区域调整后，街道、村（社区）管辖范围增加，所辖人口增加，面临的矛盾问题增多，情况更加复杂，这给基层治理带来不小的挑战。
